9月11日至20日，2023第二届中国青少年足球联赛女子初、高中年龄段U16组第三阶段比赛在江苏盐城昱丰足球训练基地进行，经过10天47场比赛，决出了第3-16名，而冠亚军决赛计划于12月初在北京进行。

第三阶段比赛由在第二阶段晋级的16支球队参加，根据第二阶段成绩排名进行分档并抽签，所有球队分为4个小组。小组赛采取单循环赛制，根据积分排名各小组前两名共8支球队进行1-8名排位赛，各小组后两名共8支球队进行9-16名排位赛。

经过三轮小组赛，辽宁、琼中、上海、山东体彩、成都棠湖、北京、江苏和山东精花八支球队进入1-8名排位赛。在排位赛中，山东体彩队和北京队进入冠军亚决赛，比赛预计将于11月底或12月初进行。在昨天进行的3-4名决赛中，上海队5-0大胜成都棠湖中学队，获得季军，成都棠湖中学队获得第四名。

第5-16名依次为：江苏、辽宁、山东精花、海南琼中、陕西、大连足校、杭州体育场、福建、武汉、广东足协二队、保定金瑞、河北青年。